运输产业包括道路客运、通勤班车、旅游包车、出租车、校车等传统客运业务，以及为适应新的市场形势推出的定制快车、曹操专车、机场专线、医疗直通车、非急救转运等互联网+的业务。其中，主业道路客运现有12家运输分公司和控股子公司，各类大型营运客车800余辆，营运线路313条，辐射19个省、市、自治区的359个县市，承担着南京70%以上的公路长途旅客运输任务。
南京长运公路运输有限公司成立于2012年12月，现有宇通、沃尔沃、苏州金龙等各类中高档营运客车143辆，其中LNG清洁能源客车88辆；营运线路21条，辐射南通、盐城、徐州、泰州、连云港、淮安、扬州、常熟等市县，年发送旅客300万人次。公司坚持安全第一，服务至上的经营理念，遵循公车公营的经营模式，拥有技术精湛、服务过硬的驾驶员队伍，驾驶员顾洁2016年被授予南京市技术能手，2017年被授予“南京市五一劳动奖章”、首届“南京工匠（汽车驾驶）”；驾驶员李龙艳2014年被评为南京市劳动模范、南京市365好人、南京市技术能手等称号；驾驶员唐杰等被授予南京技术能手、江苏省交通技术能手等称号。南京至常熟班线荣获南京市“工人先锋号”。公司先后参加了2013年南京亚青会、2014年南京青奥会、2017年世界轮滑锦标赛和2018年世界羽毛球锦标赛交通运输保障服务。
南京白鹭高速客运股份是专门从事长途客运及旅游运输的股份制企业，是具有一级道路客运经营资质、省市际旅客班线运输及省市际旅游包车运输资格的专业客运企业，并拥有ISO9001:2015质量体系认证和安全标准化一级资质。经营范围包括长途客运、旅游包车、商务包车、赛事包车、通勤车等业务。先后为2013年南京亚青会、2014年南京青奥会、国家公祭日、2017世界轮滑锦标赛、2016-2017赛季CBA联赛、2018年上海合作组织会议、2018年羽毛球世锦赛等大型赛事活动提供交通运输保障服务；现有通勤车客户15家，日发送通勤车43班次。白鹭人凭着诚实守信的经营理念，服务至上的工作作风，获得了一系列的荣誉，涌现了许多先进典型：白鹭品牌于2012年获得南京市名牌称号，2015年度荣获江苏省名牌称号；公司于2013年荣获“第二届亚洲青年运动会交通运输保障优秀团队”、2015年荣获“服务保障南京青奥会立功单位”；公司驾驶员徐友祥于2016年被评为南京市第四届“最美交通人”，同年入围“南京工匠”选拨资格，被授予南京市交通运输系统“技术能手”、江苏省交通技术能手荣誉称号，2017年被授予南京市五一劳动奖章，2018年被授予南京市劳动模范；驾驶员范本华2014年被评为南京市第二届“最美交通人”，2015年被授予南京市“五一创新能手”、南京市“十佳文明职工”、全省道路、水路运输行业“十佳感动人物”提名奖，2017年被评为江苏省“最美交通人”，2018年被授予第十六届“南京好市民”称号。
长客运输公司是主要从事省际班线运营和道路接驳运输的专业运输公司，拥有宇通、苏州金龙、安凯、尼奥普兰、桂林大宇等各类中档营运客车117辆，拥有接驳资质的19辆。营运路线130条，辐射苏、浙、鲁、皖、豫、湘、鄂、陕、晋、冀、辽等13个省市。公司拥有优秀的驾驶员队伍，驾驶员陆世荣先后被授予江苏省“五一劳动奖章”、省技术能手、省五一创新能手、南京市银牌驾驶员。
江苏长运定制客运服务南京有限公司是由江苏南京长途汽车客运集团有限责任公司和江苏长运定制客运服务有限公司共同投资组建。成立于2015年11月。现有管理人员10人，驾驶服务人员38人，营运车辆38辆，其中7座奔驰20辆、12座大通2辆、45座以上大客16辆。公司以“巴士管家”为平台，以实现公路客运服务“门到门”为核心，充分发挥道路客运企业专业化、规模化、网络化、品牌化等线下优势，积极创新运输产品和组织方式，不断提高公路客运核心竞争力。主营业务产品有健康专线、机场专线、公务定制出行专线、综合旅游出行服务专线等。自运营以来，遵循方便顾客出行的理念，通过设立多种服务点，避免顾客出行的频繁换乘，实现顾客就近、方便、舒心出行。以优质的创新服务，有力的安全保障及高效的运行管理，获得了顾客的青睐。
南京利凯汽车租赁有限公司于2015年5月9日成立，注册资金1000万元，是江苏南京长途汽车客运集团有限责任公司全资子公司。托管了政源通实业有限公司、宁港汽车运输有限公司。主营汽车租赁、专车服务、出租车、汽车贸易、集装箱出入境运输等业务。在专车经营方面，公司拥有各类型中高档轿车、商务车44辆。在2013年至2018年期间，参与了青奥会、亚青会、APEC会议、世界轮滑赛及世界羽毛球赛等重大活动与赛事的交通运输服务保障任务，并以优质的服务实现了交通服务“零投诉”，获得了社会的一致好评。目前，公司致力于互联网+的运用，打造线上线下用车服务平台，结合国有企业长期以来形成的规范安全运营传统和经验，在省、市际商务快线、定制客运、专车服务上不断突破发展。寻求各类合作伙伴的加入。
南京白鹭快件运输有限公司是江苏南京长途汽车客运集团有限责任公司下属的快件运输企业。在小红山长途汽车站、汽车东站、汽车南站均设有营业点，依托上千客运班次的营运网络，业务范围辐射上海、浙江、安徽、河北、河南、山东、湖北、湖南、江西、广东、广西、贵州、福建、陕西、山西、辽宁等全国19个省、市及江苏省内所有地级市和上百个县、乡镇地区。快递物品可以当日到达，安全快捷。并代理销售各类快消品，还从事仓储配送业务，拥有3万平方米的仓库，具备强大的配送力量。
南京长客非急救转运服务有限公司，是南京市政府授权的承运南京市非急救转运社会化服务的独家试点企业。于2018年8月31日正式营运，首批投入了20辆“非急救转运服务车”，为南京市民康复出院与年老体弱等特殊人群的非院前医疗急救服务、个性化服务需求的转院转运，提供正规、安全、舒适、优质、高效的出行保障服务。公司的所有转运员，均接受了南京市急救中心组织的急救专业知识与技能的系统、严格培训，跟随120救护车开展学习实践，取得了美国心脏协会（AHA）基础生命支持（BLS）等培训的《急救证》。目前，公司按120急救中心标准建立了24小时调度中心，通过GPS等实现全方位的远程风险监控防范，开通了非急救转运呼叫专线“962120”，并聘请市急救中心经验丰富的老转运员担任技术服务总监，无缝对接、全程守护客户的服务需求。公司秉着“呼叫就是信任，出车就是承诺。有求必应，使命必达；准确行动，雷厉风行”的经营理念，以客户满意为最高宗旨。
南京长客优行网络科技有限公司是由南京利凯汽车租赁有限公司、杭州优行科技有限公司共同投资组建。主要负责南京地区“曹操专车”的运营。公司成立于2015年，秉持“低碳致尚、服务至上”的核心价值观，以新能源汽车为运营主体开展网约专车、出租车、同城快送、低碳商城、曹操碳银行等业务，致力于为用户提供更高品质、更多元化的绿色出行服务。“说曹操，曹操到”，曹操专车是您出行的最优选择。